Power BIデスクトップ9月バージョンで少し問題が出ました。
拡張データセット メタデータがこのバージョンから正式リリースになりました。ただそれに伴って、これまで許されていた、Power Queryをエラーを出したまま放置することが出来なくなりました。エラーが残っているとソースデータの更新が出来ません（拡張データセット メタデータへの拡張が出来ません）。
これなかなか原因がわからなかったのですが、結局これが原因のようです。
ちなみにクエリを途中まで書いて保存しておくためには以下の書き方をするそうです。
これで完成していないコードや、エラーが出ているコードをそのまま保存できます。
let
ソース=null
in
ソース
/*
let
保存しておきたいソース=いろいろ
in
存しておきたいソース
*/
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